Entre los tesoros que resguarda la Biblioteca del Museo Franz Mayer, destacan los ejemplares del Fondo Antiguo que datan del siglo XV al XIX.
El programa Conservar para el futuro, con el apoyo del Programa de Conservación Cultural de la República Federal de Alemania, inició la digitalización de incunables europeos, ejecutorias de hidalguía, misales, libros de viajeros y de coro, entre otros, con el objetivo de conformar una Biblioteca Digital que de acceso libre a estas memorias culturales del mundo.